ミルサントを襲った騒動から数ヵ月が過ぎ、季節は夏を迎えていた。しかし、今年の夏はかつてないほどの猛暑。先日の事件から働き通しの六花たちには、疲労の色が見えてきた。そんな折、六花長のリノ＝レノが、頑張ってきた六花たちにご褒美の夏休みを提案する。それぞれの六花たちが夏休みの日程を決めた後、最後にコダマも夏休みの日程を決めることに。果たしてコダマは、誰と一緒に眩しい夏休みを過ごすのか？そして、時を同じくしてミルサントに降り注ぐ流星群は、一体何を意味するのか？Flowering Days.真夏の太陽の下、花盛りの日々が――今、始まる。