近年重武装化の一途をたどる近隣諸国の脅威に備えるため、ゴーダムシティー市長は国家からの独立を宣言した…。星城鈴香の名でシティーの捜査官として活動しているワンダーレディーは、収容所爆破事件によって脱走した犯罪者たちを捕らえるために緊急出動。しかし、そこに待ち受けていたのはMr.ヘイトという謎の男であった。Mr.ヘイトの攻撃に気をとられているうちにワンダーレディーは背後から市長にクロロホルムをかがされ気絶してしまう。市長の狙いはワンダーレディーの遺伝子を培養させ、彼女と同じ力を持った兵士たち「メガソルジャー」を生産することだった。外部からの攻撃を受け付けない鋼鉄の肉体を持つワンダーレディーから遺伝子情報を得るために、市長はMr.ヘイトを使い、彼女の愛液を排出させる。薬の効果で体が思うように動かないワンダーレディーを彼女のロープで縛り上げ、徹底的に性的刺激を与えて愛液を排出させやすくなるよう調教するMr.ヘイト。だが、彼は市長の指令を無視し、新たな計画に向け動き始める。はたしてワンダーレディーはこの恐ろしい計画を阻止することができるのか？ゴーダムシティーの未来は！？［BAD END］